Comprender las capacidades de FISH frente a NGS

Entendiendo FISH y NGS

Hibridación in situ con fluorescencia (FISH) es una técnica citogenética que utiliza sondas genéticas marcadas con fluoróforos para detectar y localizar secuencias de ADN específicas dentro de un cromosoma o célula. El principio básico de la hibridación in situ con fluorescencia radica en el apareamiento de bases complementarias entre las sonda y la secuencia de ADN, ARN o ARNm objetivo. Las sondas suelen ser moléculas cortas de ADN, ARN o ARNm de cadena sencilla que están etiquetadas con colorantes fluorescentes. Cuando se exponen al ADN cromosómico desnaturalizado, las sondas se hibridan con sus secuencias complementarias, lo que permite Visualización bajo un microscopio de fluorescencia.

Secuenciación de próxima generación (NGS) La NGS ha revolucionado la investigación biológica y médica al proporcionar un acceso sin precedentes a la información genómica.información, capaz de secuenciar millones o miles de millones de fragmentos de ADN o ARN simultáneamente. Proporciona una visión general completa de la genéticainformación, lo que permite el análisis de todo el genoma, la elaboración de perfiles de expresión genética y la detección de variantes.

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Beneficios, ventajas y desventajas

FISH

Usos:
• Detección de anomalías cromosómicas en pacientes prenatales

• Identificación de translocaciones, amplificaciones y deleciones cromosómicas asociadas al cáncer.

• Diagnosticar y clasificar diferentes leucemias y linfomas.
• Diagnóstico de trastornos genéticos causados por anomalías cromosómicas.
• Identificación de patógenos microbianos o virales.

Ventajas:
• Proporciona una representación visual clara e inmediata de las secuencias objetivo.
• En comparación con otras técnicas citogenéticas, la FISH es relativamente rápida.
• Se pueden diseñar sondas para apuntar a secuencias genéticas específicas con gran precisión.

• Aplicable tanto a muestras fijas como frescas.

Desventajas:
• Limitado a un pequeño número de secuencias objetivo por experimento, normalmente entre uno y cuatro objetivos genéticos.

• Requiere mucha mano de obra y conocimientos especializados.
• Susceptible a falsos positivos y negativos.

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NGS

Usos:
• Identificar variantes genéticas asociadas a enfermedades, comprender los mecanismos de las enfermedades y desarrollar una medicina personalizada.

• Estudio de genomas microbianos, identificación de patógenos y seguimiento de brotes de enfermedades.
• Caracterización de genomas tumorales, identificación de mutaciones específicas del cáncer y desarrollo de terapias dirigidas.

Ventajas:
• Ideal para estudios de todo el genoma, análisis de expresión genética y descubrimiento de variantes.

• Permite la identificación de nuevos biomarcadores y objetivos terapéuticos.
• Aplicable a una amplia gama de muestras biológicas.

Desventajas:
• Altos costos y demandas computacionales.
• Requiere experiencia especializada en bioinformática para el análisis de datos.
• Potencial para generar grandes cantidades de datos complejos y necesidad de almacenamiento de datos.

Técnicas complementarias

En muchos casos, la hibridación in situ con fluorescencia y la secuenciación de nueva generación se pueden utilizar en combinación para proporcionar un análisis más completo. Por ejemplo, la hibridación in situ con fluorescencia se puede utilizar para validar los hallazgos de la secuenciación de nueva generación o para localizar alteraciones genéticas específicas identificadas mediante secuenciación.

Conclusión

La hibridación in situ (FISH) y la secuenciación de nueva generación (NGS) son herramientas valiosas con distintas fortalezas y debilidades. La elección de la técnica depende de la pregunta de investigación específica.recursos disponibles y el resultado deseado. Al comprender las ventajas y desventajas de cada método, los investigadores pueden seleccionar de manera eficaz el enfoque más adecuado para sus estudios.